年滿7歲，身高1.2米或以上，且已登記本澳自助通關服務的香港永久性居民，便可通過人工登記使用虹膜自助過關。年齡介乎7歲至17歲的合資格香港永久性居民，須由父、母或監護人陪同親臨澳門的登記地點辦理，並須出示登記人的出生證明正本、登記人父/母或監護人的身份證明文件（如由監護人陪同，須出示合法關係證明文件）。年齡介乎7歲至10歲的香港永久性居民，由於所持身份證未載有相片，登記時須同時出示其香港特別行政區護照作核實。

香港非永久性居民目前尚未可使用虹膜自助過關。